玩家在游戏中继续扮演普雷斯顿·马罗威（Preston
Marlowe）的角色，与“B连队”，即“叛逆连队”，展开新一场冒险旅程。此时，B连队的士兵们已经归队，这意味着他们可以使用自己军队提供的各种支援，不必再四处搜寻、掠夺物资。
在《战地：叛逆连队2》的游戏背景中，国际局势已经完全恶化，俄美战争全面打响，俄军进攻阿拉斯加的战役已持续近两星期。游戏开始时，B连队正在阿拉斯加活动，受上级指示准备执行新的计划，追寻敌人的秘密武器。
在剧情设定方面，《战地：叛逆连队2》的口味将变得比较严肃，黑色幽默成分则相应的有所减少。故事更多地刻画了几个士兵间深厚的情谊，从而在他们遇险时渲染出强烈的“战争悲剧色彩”。
